在古希腊的阿尔戈斯有一位国王。一天，他到神庙里去求神问卜，得到的神谕说，他将死于自己的女儿和宙斯所生的外孙珀耳修斯之手。
老人听了这话非常害怕，他狠了狠心，趁女儿和珀耳修斯熟睡之机，把母子俩放进一个大箱子里，然后投入了大海。他以为这个大箱子就是不被惊涛骇浪所吞没，母子俩也迟早会饿死的。孰料大神宙斯暗中庇护母子俩，他使木箱子漂洋过海，一直来到了一个岛国，被一位渔夫搭救了。岛上的国王听说了这件事很觉诧异，又见小珀耳修斯生得灵气十足，就收他做了养子。

国王对自己的这位养子喜爱异常，他用心抚育珀耳修斯，为他请来了岛上各个领域的能人。珀耳修斯也许因为具有神的血统，所以生来聪明好学，不出几年，世上又多了一位无所不能的英雄豪杰。
珀耳修斯的英雄业绩很快就传到了上天，一天，智慧女神雅典娜（她是宙斯最喜爱的女儿，是希腊人特别是雅典人最崇拜的女神，雅典城就是用她的名字命名的）找到了他，要珀耳修斯把女妖美杜莎的头取来给她。珀耳修斯是个喜欢迎接挑战的人，他非常痛快地答应了女神的要求。
美杜莎原来是个十分美丽的少女，长着一头披肩的秀发。可她自视长得好，竟然不自量力地和智慧女神比起美来。雅典娜被激怒了，她施展法术，把美杜莎的那头秀发变成了无数毒蛇。美女因此成了妖怪。更可怕的是，她的两眼闪着骇人的光，任何人哪怕只看她一眼，也会立刻变成毫无生气的一块大石头。
为了取得美杜莎的头，珀耳修斯设法得到了三件宝物：一双穿上以后就可以腾云驾雾的飞鞋，一只皮囊，一顶戴在头上就可以隐形的狗皮盔。有了这三件宝物，再拿上他的青铜盾和宝刀，珀耳修斯起身向美杜莎盘据的地方飞去。
到达时，美杜莎正在熟睡。珀耳修斯不敢看她，他从青铜盾的反光中找准了美杜莎的位置，走上前去，一刀砍下了她长满毒蛇的头。珀耳修斯把这颗血淋淋的头装进了革囊，并赶紧飞到天上。这时，和美杜莎生活在一起的两个女妖被惊醒了，她们发觉同伴被杀，急忙来追。幸亏珀耳修斯戴着狗皮盔，才没被她们发现。这时，从美杜莎的身子里变出了一匹飞马，珀耳修斯立即跳上去，飞马长啸一声向远方飞去。
珀耳修斯驾着飞马日夜兼程，忽然有一天，在飞临地中海上空的时候，刮起了狂风。他和飞马几经周旋，还是被吹落到了埃塞俄比亚海岸。珀耳修斯正想找个避风的地方休息一下，猛然间，他发现在岸边的岩石上，一条又粗又长的铁链子紧紧地锁着一位少女。她的长发浸在海水中，娇弱的身体任凭风吹雨打。
珀耳修斯三步并做两步跑上去。他正要救出少女，可对方却满脸愁容，有气无力地对他说：“快别碰我，我是有罪的人，是献给海神的牺牲。”“再有罪，也不能受这样的折磨！”说完，不等少女答话，珀耳修斯一刀砍断了铁链。
女孩喘息了好半天，才缓缓地向勇士说起了她的身世：“我叫安德洛美达，是埃塞俄比亚国王的女儿。我的妈妈因为我和她都长得十分美貌，便常在众人面前夸耀，说我们是世界上最美的人，甚至连海神的女儿——海洋中最美的爱琴海的神女也比不过。这句话触怒了海神的一家，他们兴风作浪，使我们的国家洪水泛滥，人民流离失所。
他们还派来一头鲸鱼怪，这个家伙平时潜在水中，见到岸边有人，就偷偷浮上来，一口把人吞下肚去。人们吓得实在没有办法，就到庙里去祈求神灵保佑。神谕说我是罪魁祸首，非得把我锁在这里祭献给海神才行，否则更大的灾难就会降临到我们的国家。”
听了安德洛美达的话，珀耳修斯也有点不寒而栗。可为了挽救无辜少女的生命，更为了主持正义，他毅然决定向海神的权威挑战！这时，那条鲸鱼怪又从海底升了上来。它挪动着小山一样的身躯，张着山洞一般的大口，向他俩不紧不慢地靠了过来。
珀耳修斯急忙让安德洛美达闭上眼，其实不等他开口，她早就吓得昏了过去。珀耳修斯装做害怕的样子，慢慢地向后退。突然，他把美杜莎的头猛地举到了鲸鱼怪的面前。还没看清是怎么回事，妖怪一下就变成了立在海边的一块巨大的岩石。
等待着死神降临的安德洛美达慢慢地睁开眼，当她明白了这一瞬间发生的事后，激动得紧紧抱住珀耳修斯哭了。海神波赛冬就此领教了珀耳修斯的神勇，只得偃旗息鼓，这个国家又恢复了往日的宁静。
珀耳修斯的壮举赢得了国王、王后和全国人民的敬意，也赢得了安德洛美达的心。不久，俩人幸福地结合了。婚后夫妻俩回到了珀耳修斯的出生地。珀耳修斯的外祖父想到了早年的神谕，他真害怕死在外孙的手里，于是就悄悄地躲到了另外一个国家。
有一年，这个国家举行盛大的节日晚会，外祖父就坐在国王的身边。珀耳修斯也应邀出席了晚会，并即兴做掷铁饼的表演。哪知道他投出的铁饼不偏不斜，正好砸在了外祖父的头上。二十年前的神谕果真应验了，老人真的死在了自己的外孙手里。
珀耳修斯悲痛不已。为了安慰他，也为了报答他对自己的帮助，智慧女神雅典娜请求宙斯把珀耳修斯提升到了天界，变成了秋夜星空中的英仙座。珀耳修斯的妻子安德洛美达和她的父母也都升到了天上，这便是在北天闪耀着光辉的王族星座——仙女座、仙王座和仙后座。
珀耳修斯刺杀美杜莎后，从美杜莎的身子里跳出来的那匹飞马，也曾为珀耳修斯的壮举立下汗马功劳。为了表彰它对珀耳修斯的帮助，宙斯把它也提升到天界，变成了飞马座。有趣的是，海神派到安德洛美达的国家兴风作浪的那头鲸鱼怪也被宙斯放到了天上，这就是鲸鱼座。宙斯这么做，与其说是为了表彰珀耳修斯的神勇，倒不如说是给他的兄弟海神波赛冬个面子。